Fischer im Dorf Le Séchey gelegen
Aufgrund des geschlossenen Charakters seines Einzugsgebiets wurden die Fischarten, die den Lac de Joux bevölkern, alle von Menschenhand eingeführt. Es handelt sich dabei hauptsächlich um die Seeforelle, den Hecht, die Felchen und den Barsch. Auch Hasel, Rotauge und Schleie sind hier anzutreffen. Sehr viel seltener sind Quappen und Äschen, die stark von der Eutrophierung der Gewässer betroffen sind (Überangebot an Nahrung im Ökosystem).
